肥後国はおよそ熊本県にあたる。ここでは、論社や参考社、旧地なども含めて一覧にしている。

阿蘇郡 3座　大社1座　小社2座

健磐龍命神社 名神大

阿蘇神社

［住所］阿蘇市一の宮町宮地3083-1
［電話］0967-22-0064

阿蘇山上神社

［住所］阿蘇市黒川808-3
［電話］-

阿蘇比咩神社

阿蘇神社

［住所］阿蘇市一の宮町宮地3083-1
［電話］0967-22-0064

阿蘇山上神社

［住所］阿蘇市黒川808-3
［電話］-

國造神社

国造神社

［住所］阿蘇市一の宮町手野2100
［電話］076-244-3129

阿蘇神社

［住所］阿蘇市一の宮町宮地3083-1
［電話］0967-22-0064

玉名郡 1座　大社0座　小社1座

疋野神社

疋野神社

［住所］玉名市立願寺457
［電話］0968-72-2917
【関連記事】
・延喜式神名帳 - 確実に1000年以上前から存在、1000年以上にわたって存在する神社
・神社いろいろ - 社格や形式などで神社を分類したまとめ - 『延喜式』と神社