御崎神社（みさきじんじゃ）は、山梨県甲府市美咲にある神社。近代社格では村社。参拝すれば、御朱印を頂ける。

『式内社調査報告』によれば、「塚原村御崎明神」が『延喜式』巻9・10神名帳 東海道神 甲斐国 巨麻郡「宇波刀神社」に比定される式内社（小社）の論社。

塚原村は、現在の市内塚原町のことだが、御崎と名の付く神社はない。市内全域で広げても、塚原町の南1キロほどに鎮座する当社しかない。

ただし、当社の由緒から考えて、式内論社とするのは難しいとされる。

当社は、甲斐源氏の武田氏が石和に居を構えた時、その居館内に祀られたという。石和八幡宮の由緒から、鎌倉時代初期の建久3年（1192年）以降のことと考えられる。

御祭神は、大国主神・保食神・和産霊神。

戦国時代の永正16年（1519年）6月、武田信虎が石和から躑躅ヶ崎に居を移し、築城したため、その三の郭内に神殿を建立されて遷座した。

天正3年（1575年）4月、城外の西南、塔岩地内に社殿が再建されたが、天正10年（1582年）3月の天正壬午の乱により社殿が大破した。

徳川家康が甲斐巡視の際、当社に参拝し、御崎大相撲を上覧、これより御崎大相撲は甲斐国三相撲の一つとして有名になった。

文禄3年（1594年）、甲府城築城の際、現在地に神領を賜り、遷座、甲府城の守りと甲府北部一帯の氏神と定められた。

社殿、随神門なども戦火を逃れ、現在の拝殿は昭和5年（1930年）に改築されたもの。例祭は9月19日。

なお、式内社「宇波刀神社」の論社は他に、北杜市・甲府市・韮崎市に式内同名神社がある。

また、八代郡の式内社に同音の「表門神社」があり、市川三郷町と甲府市の式内同名神社、甲府市の五社神社、市川三郷町の正一位浅間神社がそれぞれ論社。

さらに、美濃国安八郡にも同名の式内社があり、安八町の「うばと」と神戸町の「うわと」がそれぞれ論社。

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