種類によってだいぶ違うものの、多くの天然記念物は、数百年、数千年という単位で存在し続けているものであり、その神社も、この天然記念物と関わった創祀や由緒を持つものが珍しくない。

国の折り紙付きの自然のパワーがある、ある意味では最強のパワースポット。それが、「国の天然記念物がある神社」といえるかもしれない。

※　特別天然記念物
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北海道・東北地方

青森県 法量神社

［指定］法量のイチョウ
［住所］十和田市法量字山ノ下25
［電話］-

宮城県 鹽竈神社

［指定］鹽竈神社の鹽竈ザクラ
［住所］塩竈市一森山1-1
［電話］022-367-1611 - 志波彦神社・鹽竈神社

山形県 出羽三山

［指定］羽黒山のスギ並木※、南谷のカスミザクラ、羽黒山の爺スギ
［住所］鶴岡市羽黒町手向7
［電話］0235-62-2355

山形県 熊野神社（鶴岡市水沢）

［指定］熊野神社の大スギ
［住所］鶴岡市水沢熊野前53
［電話］-

山形県 三瀬気比神社

［指定］三瀬気比神社社叢
［住所］鶴岡市三瀬字宮ノ前1
［電話］0235-73-3148

福島県 諏訪神社

［指定］諏訪神社の翁スギ媼スギ
［住所］田村郡小野町夏井町屋33
［電話］0247-72-5566

福島県 鹿島神社（郡山市西田町）

［指定］鹿島神社のペグマタイト岩脈
［住所］郡山市西田町丹伊田宮作33
［電話］024-971-3276

福島県 隠津島神社（二本松市）

［指定］木幡の大スギ
［住所］二本松市木幡治家49
［電話］0243-46-2869

関東地方

茨城県 水戸八幡宮

［指定］白旗山八幡宮のオハツキイチョウ
［住所］水戸市八幡町8-54
［電話］029-226-8854

茨城県 安良川八幡宮

［指定］安良川の爺スギ
［住所］高萩市安良川1173
［電話］0293-22-3611

茨城県 磯部稲村神社

［指定］桜川のサクラ
［住所］桜川市磯部779
［電話］0296-75-2838

茨城県 夷針神社

［指定］大戸のサクラ
［住所］東茨城郡茨城町大戸1768
［電話］-

群馬県 榛名神社

［指定］榛名神社の矢立スギ
［住所］高崎市榛名山町849
［電話］027-374-9050

埼玉県 金鑚神社

［指定］御岳の鏡岩
［住所］児玉郡神川町字二ノ宮
［電話］0495-77-4537

埼玉県 宝登山神社

［指定］長瀞
［住所］秩父郡長瀞町長瀞1828
［電話］0494-66-0042

千葉県 葛飾八幡宮

［指定］千本イチョウ
［住所］市川市八幡4-2-1
［電話］047-332-4488

千葉県 神崎神社（神崎町）

［指定］神崎の大クス
［住所］香取郡神崎町神崎本宿1944
［電話］0478-72-3161

東京都 白山神社

［指定］練馬白山神社の大ケヤキ
［住所］練馬区練馬4-1-2
［電話］03-3991-2888

東京都 武蔵御嶽神社

［指定］御岳の神代ケヤキ
［住所］青梅市御岳山176
［電話］0428-78-8500

東京都 幸神神社

［指定］幸神神社のシダレアカシデ
［住所］西多摩郡日の出町大久野
［電話］03-3991-2888

東京都 大國魂神社

［指定］馬場大門のケヤキ並木
［住所］府中市宮町3-1
［電話］042-362-0092

中部地方

新潟県 天神社

［指定］天神社の大スギ
［住所］妙高市関川1578
［電話］-

新潟県 鵜川神社（新道）

［指定］鵜川神社の大ケヤキ
［住所］柏崎市大字新道5127
［電話］0257-24-9738

新潟県 宮川神社（柏崎市）

［指定］宮川神社社叢
［住所］柏崎市大字宮川4027
［電話］-

新潟県 能生白山神社

［指定］能生白山神社社叢
［住所］糸魚川市大字能生7239
［電話］025-566-3465

新潟県 筥堅八幡宮

［指定］筥堅八幡宮社叢
［住所］村上市勝木字筥竪山1411-甲
［電話］0254-77-2259

富山県 鹿嶋神社

［指定］宮崎鹿島樹叢
［住所］下新川郡朝日町宮崎1484
［電話］0765-82-2197

石川県 菅原神社

［指定］栢野の大スギ
［住所］加賀市山中温泉栢野町ト49
［電話］0761-78-0694 - 白山神社

石川県 八幡神社（菅谷町）

［指定］八幡神社の大スギ
［住所］加賀市山中温泉菅谷町ヘ114
［電話］0761-78-0694 - 白山神社

石川県 氣多大社

［指定］気多神社社叢
［住所］羽咋市寺家町ク1
［電話］0767-22-0602

石川県 鹿島神社

［指定］鹿島の森
［住所］加賀市塩屋町「鹿島の森」
［電話］0761-72-7900 - 市観光交流課

石川県 須須神社

［指定］須須神社社叢
［住所］珠洲市三崎町寺家4-2
［電話］0768-88-2772

福井県 杉森神社（高浜町）

［指定］杉森神社のオハツキイチョウ
［住所］大飯郡高浜町六路谷24-3-1
［電話］-

福井県 小浜神社（小浜市）

［指定］小浜神社の九本ダモ×
［住所］小浜市城内1-7-55
［電話］0770-52-1920

山梨県 根古屋神社

［指定］根古屋神社の大ケヤキ
［住所］北杜市須玉町江草字根古屋5336
［電話］0551-47-4747

山梨県 上暮地山之神社

［指定］山ノ神のフジ
［住所］富士吉田市上暮地2114
［電話］-

長野県 素桜神社

［指定］素桜神社の神代ザクラ
［住所］長野市泉平素桜513
［電話］026-224-5042

岐阜県 久津八幡宮

［指定］久津八幡神社の夫婦スギ
［住所］下呂市萩原町上呂2345-1
［電話］0576-24-2222

岐阜県 神淵神社

［指定］神渕神社の大スギ
［住所］加茂郡七宗町神渕4168-1
［電話］-

岐阜県 白山神社（泉中窯町）

［指定］白山神社のハナノキおよびヒトツバタゴ
［住所］土岐市泉中窯町1-38
［電話］0572-55-3771

岐阜県 一位森八幡神社

［指定］一位森八幡神社社叢
［住所］高山市高根町日和田821
［電話］0577-59-2216

岐阜県 大山白山神社

［指定］大山の大スギ
［住所］加茂郡白川町水戸野1097-7
［電話］0574-72-2022

岐阜県 大矢田神社

［指定］楓谷のヤマモミジ樹林
［住所］美濃市大矢田2596
［電話］0575-35-3660 - 美濃市観光協会

洲原神社

［指定］洲原神社ブッポウソウ繁殖地
［住所］美濃市須原468-1-1
［電話］0575-32-2363

静岡県 来宮神社

［指定］阿豆佐和気神社の大クス
［住所］熱海市西山町43-1
［電話］0557-82-2241

静岡県 葛見神社

［指定］葛見神社の大クス
［住所］伊東市馬場町1-16-40
［電話］0557-37-1050

静岡県 杉桙別命神社

［指定］杉桙別命神社の大クス
［住所］賀茂郡河津町田中154
［電話］0558-32-0800

静岡県 八幡宮（下田市吉佐美）

［指定］八幡神社のイスノキ
［住所］下田市吉佐美1722-1
［電話］0558-22-1531

静岡県 伊古奈比咩命神社

［指定］伊古奈比咩命神社のアオギリ自生地
［住所］下田市白浜2740
［電話］0558-22-1183

静岡県 三嶋大社

［指定］三島神社のキンモクセイ
［住所］三島市大宮町2-1-5
［電話］055-975-0172

静岡県 大瀬神社

［指定］大瀬崎のビャクシン樹林
［住所］沼津市西浦江梨大瀬329
［電話］055-942-2603

静岡県 諸口神社

［指定］御浜岬のイヌマキ群生地
［住所］沼津市戸田2711
［電話］0558-94-2080 - 戸田漁業協同組合

静岡県 八幡宮来宮神社

［指定］八幡野八幡宮・来宮神社社叢
［住所］伊東市八幡野1
［電話］0557-53-2861

愛知県 神明社（上永良）

［指定］神明社の大シイ
［住所］西尾市上永良町宮東11
［電話］-

愛知県 羽豆神社

［指定］羽豆神社の社叢
［住所］知多郡南知多町大字師崎字明神山1
［電話］0569-63-0790

愛知県 八百富神社

［指定］八百富神社社叢
［住所］蒲郡市竹島町3-15
［電話］0533-68-3700

愛知県 鳳来山東照宮

［指定］鳳来寺山
［住所］新城市門谷字鳳来寺4
［電話］0536-35-1176

近畿地方

三重県 高倉神社（伊賀市）

［指定］高倉神社のシブナシガヤ
［住所］伊賀市西高倉1050-2
［電話］0595-21-5864

三重県 九木神社

［指定］九木神社樹叢
［住所］尾鷲市九鬼町455
［電話］0597-23-8223 - 市水産商工食のまち課

三重県 多比鹿神社

［指定］田光のシデコブシ及び湿地植物群落
［住所］三重郡菰野町田光2063
［電話］-

大阪府 三島神社（門真市）

［指定］薫蓋クス
［住所］門真市三ツ島1374
［電話］072-883-0788

大阪府 野間神社

［指定］野間のケヤキ
［住所］豊能郡能勢町地黄399
［電話］-

京都府 大田神社（京都市）

［指定］大田ノ沢のカキツバタ群落
［住所］京都市北区上賀茂本山340
［電話］075-781-0907

兵庫県 追手神社

［指定］追手神社のモミ
［住所］篠山市大山宮302
［電話］079-552-6907

兵庫県 大避神社

［指定］生島樹林
［住所］赤穂市坂越1297
［電話］0791-48-8136

奈良県 春日大社

［指定］春日山原始林※、春日神社境内ナギ樹林
［住所］奈良市春日野町160
［電話］0742-22-7788

奈良県 丹生川上神社（中社）

［指定］丹生川上中社のツルマンリョウ自生地
［住所］吉野郡東吉野村小968
［電話］0746-42-0032

奈良県 與喜天満神社

［指定］与喜山暖帯林
［住所］桜井市初瀬14
［電話］0744-55-2300

奈良県 桜実神社

［指定］八ッ房杉
［住所］宇陀市菟田野佐倉764
［電話］-

和歌山県 熊野速玉大社

［指定］熊野速玉神社のナギ
［住所］新宮市新宮1
［電話］0735-22-2533

和歌山県 熊野那智大社

［指定］那智原始林
［住所］東牟婁郡那智勝浦町那智山1
［電話］0735-55-0321

中国地方

鳥取県 松上神社（松上）

［指定］松上神社のサカキ樹林
［住所］鳥取市松上326
［電話］0857-56-0245

鳥取県 倉田八幡宮

［指定］倉田八幡宮社叢
［住所］鳥取市馬場299
［電話］0857-53-1235

鳥取県 大野見宿禰命神社

［指定］大野見宿禰命神社社叢
［住所］鳥取市徳尾80
［電話］-

鳥取県 白兎神社

［指定］白兎神社樹叢
［住所］鳥取市白兎592
［電話］0857-59-0047

鳥取県 波波伎神社

［指定］波波伎神社社叢
［住所］倉吉市福庭654
［電話］0858-23-2008 - 倉吉市観光協会

島根県 玉若酢命神社

［指定］玉若酢命神社の八百スギ
［住所］隠岐郡隠岐の島町下西713
［電話］08512-2-0571

広島県 忠海八幡神社

［指定］忠海八幡神社社叢
［住所］竹原市忠海中町3-7-15
［電話］0846-26-0859

山口県 出雲神社（山口市）

［指定］出雲神社ツルマンリョウ自生地
［住所］山口市徳地堀3577
［電話］0835-52-0365

山口県 忌宮神社

［指定］干珠樹林、満珠樹林
［住所］下関市長府宮の内1-18
［電話］083-245-1093

四国地方

徳島県 乳保神社

［指定］乳保神社のイチョウ
［住所］板野郡上板町瀬部763
［電話］088-694-6814 - 上板町教育委員会

香川県 皇子神社（小豆島町）

［指定］皇子神社社叢
［住所］小豆郡小豆島町神浦甲860
［電話］0879-82-7014

香川県 菅生神社

［指定］菅生神社社叢
［住所］三豊市山本町辻1433
［電話］0875-63-3695

香川県 天川神社

［指定］天川神社社叢
［住所］仲多度郡まんのう町造田3431
［電話］0877-73-0105

愛媛県 伊吹八幡神社

［指定］八幡神社のイブキ
［住所］宇和島市伊吹町1068
［電話］0895-22-1282

愛媛県 一宮神社（新居浜市）

［指定］新居浜一宮神社のクスノキ群
［住所］新居浜市一宮町1-3-1
［電話］0897-32-2054

愛媛県 大山祇神社

［指定］大山祇神社のクスノキ群
［住所］今治市大三島町宮浦3327
［電話］0897-82-0032

高知県 八坂神社

［指定］杉の大スギ※
［住所］長岡郡大豊町杉794
［電話］0887-72-0450

九州・沖縄地方

福岡県 太宰府天満宮

［指定］太宰府神社のクス、太宰府神社のヒロハチシャノキ
［住所］太宰府市宰府4-7-1
［電話］092-922-8225

福岡県 宗像大社（沖津宮）

［指定］沖の島原始林
［住所］宗像市大島沖ノ島
［電話］-

福岡県 宇美八幡宮

［指定］湯蓋の森・衣掛の森（クスノキ）
［住所］糟屋郡宇美町宇美1-1-1
［電話］092-932-0044

福岡県 英彦山神宮

［指定］英彦山の鬼スギ
［住所］田川郡添田町英彦山1
［電話］0947-85-0001

長崎県 大村神社（大村市）

［指定］大村神社のオオムラザクラ
［住所］大村市玖島1-34
［電話］0957-53-4835

熊本県 国造神社

［指定］手野のスギ×
［住所］阿蘇市一の宮町手野2100
［電話］076-244-3129

大分県 柞原八幡宮

［指定］柞原八幡宮のクス
［住所］大分市大字八幡987
［電話］097-534-0065

大分県 大杵社

［指定］大杵社の大スギ
［住所］由布市湯布院町川南746-19
［電話］0977-84-3111

大分県 堅田郷八幡社

［指定］堅田郷八幡社のハナガガシ林
［住所］佐伯市長谷9683-2
［電話］0972-23-3400

大分県 宇佐神宮

［指定］宇佐神宮社叢
［住所］宇佐市南宇佐2859
［電話］0978-37-0001

大分県 緩木神社

［指定］緩木神社の松×
［住所］竹田市大字九重野848
［電話］-

宮崎県 瓜生野八幡神社

［指定］瓜生野八幡のクスノキ群
［住所］宮崎市大瀬町5714
［電話］0985-41-2641

宮崎県 宮崎神宮

［指定］宮崎神社のオオシラフジ
［住所］宮崎市神宮2-4-1
［電話］0985-27-4004

宮崎県 都萬神社

［指定］妻のクス
［住所］西都市妻１
［電話］0983-43-1238

南方神社

［指定］上穂北のクス
［住所］西都市南方3246
［電話］-

宮崎県 青島神社

［指定］青島亜熱帯性植物群落※
［住所］宮崎市青島2-13-1
［電話］0985-65-1262

宮崎県 下野八幡大神社

［指定］下野八幡宮のイチョウ、下野八幡宮のケヤキ
［住所］東臼杵郡高千穂町大字下野569
［電話］0982-73-1212

宮崎県 狭野神社

［指定］狭野神社ブッポウソウ繁殖地
［住所］西諸県郡高原町蒲牟田117
［電話］0984-42-1007

宮崎県 鵜戸神宮

［指定］ヘゴ自生北限地帯
［住所］宮崎県日南市大字宮浦3232
［電話］0987-29-1001

鹿児島県 菅原神社

［指定］藤川天神の臥龍梅
［住所］薩摩川内市東郷町藤川1767
［電話］0996-42-0753

鹿児島県 安楽山宮神社

［指定］志布志の大クス
［住所］志布志市志布志町安楽1520
［電話］099-472-3437

鹿児島県 蒲生八幡神社（姶良市）

［指定］蒲生の大クス※
［住所］姶良市蒲生町上久徳2259-1
［電話］0995-52-9029

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