甲佐神社（こうさじんじゃ）は、熊本県上益城郡甲佐町にある神社。肥後国二宮で、近代社格では郷社。御朱印の有無は不明。

阿蘇神社（阿蘇市）、郡浦神社（宇城市）、健軍神社（熊本市東区）とともに阿蘇四社と称せられる、肥後南方の守護神。創建は第8代孝元天皇26年とも言われる。

もともと鏑崎宮（かぶらざきぐう）と称したが、神功皇后凱旋ののち、甲冑を納められたので甲佐宮と改めたと言われる。神功皇后の甲冑に関する伝承は、福岡県北九州市門司区の甲宗八幡神社にも残る。

甲佐三宮大明神とも称するのは、一殿に甲佐、二殿に阿蘇、三殿に郡浦の三神を祀るため。肥後国二宮の三宮大明神で、若干紛らわしい。

鎌倉時代の武士・竹崎季長が 『蒙古襲来絵詞』を奉納したことでも知られる。郡浦神社、健軍神社とともに阿蘇神社の摂社となる。

健磐龍命（たけいわつのみこと）の御子、八井耳玉命（やいみみたまのみこと、甲佐明神）を主祭神とし、健磐龍命、蒲池比咩命（かまちひめのみこと）、神倭磐余彦命、媛蹈鞴五十鈴媛命を配祀する。例祭は10月9日。

なお、八井耳玉命は、阿蘇神社の主祭神健磐龍命の子で、速瓶玉命の異母弟であると神系図では位置づけられている。

しかし、他に神武天皇の第二皇子神八井耳命の異母弟説、神八井耳玉命が阿蘇家の祖惟人命説、など様々な説があるという。

当社とその周辺には、異常に赤星姓が多いことでも知られている。こちらが詳しい。

【ご利益】
武運長久、勝運、厄祓い、地域開拓、家内安全など

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