三上六所神社（みかみろくしょじんじゃ）は、滋賀県甲賀市にある神社。鈴鹿山脈の山懐に鎮座。

元伊勢伝承のある大神宮社、天王神社、大皇神社、貴船神社（高龗神）、吉野神社（蔵王権現）の五所と本社を併せたことが社名の由来。

主祭神は天之御影神、三上三郎公。元正天皇（以上本社御祭神）、天照大御神、豊受大御神（以上大神宮社御祭神）、惟喬親王（大皇神社御祭神）、稲倉魂命・素盞鳴命・大己貴命（以上天王神社御祭神）を配祀する。

その昔、このあたりで毒蛇猛獣の被害に遇う村人が後を絶たないため、野州（現 滋賀県野州）の御上神社（天之御影神）に祈願。

御上神社とその御祭神・天之御影神に奉仕していた三上三郎が、二匹の犬を連れて来て、猛獣や毒蛇を駆除したことで、安心して人が住めるようになったという。

この三上三郎氏の遺徳を崇敬するため、御上神社の御祭神、天之御影神および元正天皇を合祀し、村の鎮守としたという。境内には奉納されたと思われる犬の石像がある。

今の社殿は享保8年（1723年）の造営、明治42年（1909年）に大神宮社など無格社五社を本社に合祀する。境内社に吉野神社、稲荷社がある。例祭は10月15日。

社殿の右側にケヤキの巨木があることで知られる。また、付近を流れるうぐい側は桜の名所としても有名で、春になると普段は静かな山里も花見客で大変な賑わいになる。

【ご利益】
猛獣・毒蛇駆除、武運長久、家内安全、五穀豊穣、厄除け

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