奈良県橿原市の橿原神宮、久米寺のほか、吉野町ではやはり世界遺産である金峯山寺、東南院、葛城市の当麻寺でも被害が見つかっているといいます。現在までに確認されているのは下記の京都・奈良の社寺12社。

・二条城（京都市）…世界遺産。被害は国宝・二の丸御殿
・東寺（京都市南区）…世界遺産。護摩壇の畳、灌頂院東門の門扉など
・長谷寺（奈良県桜井市）…国宝・本堂や、重文・木造十一面観音立像
・飛鳥寺（奈良県明日香村）
・橘寺（奈良県明日香村）
・岡寺（奈良県明日香村）
・飛鳥坐神社（奈良県明日香村）
・橿原神宮（奈良県橿原市）…外拝殿の柱、石畳など
・久米寺（奈良県橿原市）…金剛力士像など2建造物の計10か所
・金峯山寺（奈良県吉野町）…世界遺産。本堂・蔵王堂（国宝）外側の柱4本など
・東南院（奈良県吉野町）…多宝塔と護摩堂の縁側
・当麻寺（奈良県葛城市）…四天王立像のうち2像に被害

【関連記事】
・奈良・京都など世界遺産含む寺社に油のようなものがまかれていた被害、事件の推移の時系列