10月17日午後3時、当日祭に先立って斎行される「清祓」では、神職はもとより祭儀に用いる諸具に至る一切が祓い清められる。

10月18日午前10時、当日祭が行われる。午前10時30分、天皇陛下のお遣いである勅使が参向、天皇陛下よりの供え物（御幣物）が献じられ、御祭文が奏上される。

当日祭後は、第二日祭（10月19日午前10時）、第三日祭（10月20日午前10時）と当日祭同様の祭儀が執り行われ、最終日である20日午後6時には、例大祭が無事に終了することを感謝する「直会」が執り行われる。

秋季例大祭の斎行にあたり、奉祝行事として献茶式、草鹿式が行われるほか、例大祭期間中、境内では各種奉納芸能、特別献華展、奉納菊花展などが催される。

昇殿参拝は、10月17日が午前8時から午後2時まで、10月18日から20日までが午前11時30分から午後3時まで。期間中の社頭参拝は、午前6時から午後8時までとなる。

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