檜尾神社（ひのおじんじゃ、桧尾神社）は、滋賀県甲賀市にある神社。

天照大神を奉斎した倭姫命が4年間滞在した、『日本書紀』に「近江国」、『倭姫命世記』に「甲可日雲宮」とある元伊勢の伝承地の一つ。

伊勢の神宮（伊勢神宮）の皇大神宮（内宮）の元宮の可能性がある。

主祭神は天津彦彦火瓊瓊杵尊、伊邪那美尊、素戔嗚尊、蛭子命、猿田彦命、応神天皇、菅原道真公を配祀する。

社伝によれば、昔当地が滝池であった時、主祭神が青竜となって雲中に現れ、ある時、滝池の辺に炎気の尾を垂れたことにより、同神を祀って火尾社と名付けた。

しかし火災が多く発生したため、現社号の檜尾に改めたところ、火災は治まったという。

社殿は、南北朝時代の応安2年（1369年）に藤原頼康らにより再建、戦国時代の大永5年（1525年）には池田新治郎らにより屋根替えが行われた。

また、安土桃山時代の天正8年（1580）に池田信輝らにより改装され、江戸時代中期の宝永3年（1706）に再建されたものが現本殿。

春の例大祭では、猿田彦命の古式に則った、御田植祭が行われる。天狗の姿をした猿田彦命と翁面をかぶった男性、田植えの子どもが登場し、田起こしから田植え、豊作の祈りなどがシンプルな所作で演じられる。

当社文書には、「明徳3年（1392年）4月初申日御札行幸行列次第」があり、祭礼行列順と共に、獅子舞、猿彦、猿楽などあったという。

7月7日には祇園祭が斎行され、花奪いなどが行われる。

なお、元伊勢「甲可日雲宮」の候補地は多く、その他に、甲賀市に土山町頓宮の甲可日雲、土山町鮎河の三上六所神社に合祀された大神宮社、土山町大河原の若宮神社境内社である皇大神宮、信楽町多羅尾の高宮神社、信楽町牧の日雲神社、水口町神明の日雲宮、水口町東林口の五十鈴神社、水口町高山の笠山神社、水口町北内貴の川田神社、土山町頓宮の川田神社、土山町北土山の田村神社と、湖南市に三雲の上乗寺境内社である神明宮、夏見の神明神社がある。

【ご利益】
農耕、五穀豊穣、魔除け、交通安全

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